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Nature子刊:人体肠道微生物群的新基因组蓝图!
  • 发布日期:2019-02-14      浏览次数:275
    • 肠道中寄生着数以亿计的微生物,被统称为肠道微生物组(gut microbiome)。人体肠道内的微生物中,超过99%都是细菌,这些细菌大体上可分为拟杆菌(Bacteroides)、普氏菌(Prevotella)和瘤胃球菌(Ruminococci)。近年来,随着高通量测序和宏基因组学等新的研究方法的不断开发和应用,肠道微生物对人类健康的影响重新引起重视,成为当前生命科学和医学的研究热点,一些国家相继实施了人体微生物组计划并取得了突破性进展。

      肠道微生物基因组与人体基因组一起,通过与环境因素的相互作用,通过不同方式影响我们的健康。细菌参考基因组是分析肠道微生物宏基因组的基础工具,但是一些细菌无法在肠道微生物群外生存。研究人员用计算方法能够重建这些细菌的基因组。这个过程有点像在把所有的拼图混合在一起之后,重建数百个拼图。研究人员现在正处于一个阶段,他们可以使用一系列的计算工具来补充和指导实验室的工作,以揭示对人类肠道的新洞察。

      研究所博士后亚历山大·阿尔梅达表示计算方法可以让我们了解生活在人类肠道中的许多细菌种类,它们是如何进化的,它们在微生物群落中可能扮演什么样的角色。在这项研究中,他们利用了最全面的胃肠道公共数据库。威康桑格研究所的组长特雷弗·劳利总结道,像这样的研究正在帮助我们创造一个人体肠道细菌蓝图,更有助于我们理解人类健康,指导胃肠道疾病的诊断和治疗。

      研究者已把肠道微生物作为用药的对象来对待,肠道菌群俨然已是一个不可忽视的器官。

      人体微生物种类高度复杂,目前对微生物的认识还有限。未来研究人员或将利用这一数据库资源来更快速、准确且简便地研究人类机体的肠道的微生物组,并基于相关研究结果开发治疗多种人类疾病的新型诊断技术和治疗手段。

      Alexandre Almeida, Alex L. Mitchell A new genomic blueprint of the human gut microbiota

      (转化医学网)

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